男性和女性在新陈代谢方面存在差异。平均而言，女性的总能量消耗比男性低5%-10%，这可以部分解释为身体组成的性别差异。事实上，无论给定的体重指数BMI是多少，女性的体脂都要比同龄男性高出约10%。此外，脂肪的分布在两性之间也有差异。例如，年轻的绝经前妇女皮下脂肪组织较多，特别是在臀部和股骨区域，雌激素可促进皮下脂肪组织的形成。相反，年轻男性有更多的中央或腹部内脏脂肪组织。这种与生俱来的代谢差异将为代谢病的发生发展埋下伏笔。
国内外相关研究表明，脂肪组织的位置和功能比脂肪组织的质量更重要。先前的研究表明,下半身皮下脂肪臀部和股区反向与代谢疾病相关的异常,而上半身内脏脂肪腹部,这是更常见的男性,与异常的风险呈正相关葡萄糖和脂质稳态和心血管疾病。上半身内脏脂肪储存可通过增加游离脂肪酸的分泌，导致糖异生和脂蛋白合成增加，并破坏新陈代谢和胰岛素的作用，终对肝脏产生不利影响。
在肥胖人群中，不仅男性更容易受到上半身内脏脂肪堆积的影响，而且有证据表明，从内脏脂肪中游离脂肪酸的动员率在男性中比在女性中高得多。虽然数据仅代表肥胖人群，但当存在相同数量的全身脂肪时，男性比女性患继发性代谢并发症和心血管疾病的风险更高。未来的研究需要在不同体型的人群中进行。
绝经后妇女体内雌激素明显下降，这可能导致脂肪组织重新分布，从而促进中枢性肥胖。研究发现，脂肪组织脂蛋白脂肪酶活性促进脂肪储存，特别是在绝经前妇女的臀和股区域，但对绝经后妇女没有作用。外源性雌激素补充可恢复绝经后女性股脂肪细胞的脂蛋白脂肪酶活性，并减少皮下脂肪分解。在绝经前妇女中，臀脂肪细胞对胰岛素的抗脂质作用比腹部脂肪细胞更敏感，但这种脂肪储存位置的差异在绝经后妇女中消失了。这些发现表明雌激素不仅在控制女性局部脂肪组织分布，还在控制女性脂肪细胞的功能方面发挥作用。