治疗男性尿道炎的药物很多，据尿液细菌培养的结果，选用对细菌敏感性的抗生素进行治疗。
临床上，男性尿道炎，急性膀胱炎，急性前列腺炎等疾病，进行相以鉴别，建议及时去医院进行就诊，行尿液细菌培养检查，包括初段尿培养，中段尿培养和末段尿培养，明确诊断。
中成药治疗男性尿道炎，如银花泌炎灵片，银花泌炎灵片组方成分对致病菌有明显的抑制作用，通过血液循环直接作用于尿道感染部位和周边组织器官，迅速改善尿道炎导致的症状，并且尿道炎具有反复发作和迁延性，从而导致泌尿系统的免疫低下，银花泌炎灵片桑寄生有提高机体的免疫力的作用，驱邪，不损伤正气，防止疾病反复发作。